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基于一种新型马尔科夫模型的预测蛋白质亚细胞位点的方法(英文)
赵娟; 秦玉芳; 刘太岗; 王军^1,2,3
1.上海师范大学数理学院;2.上海海洋大学信息学院;3.山东农业大学信息科学与工程学院

摘要:

亚细胞位点是蛋白质很重要的功能特征.找到一种有效的、可信度高的预测蛋白质位点的方法是很必要的.提出了一种基于马尔科夫模型的改进预测方法.首先,对于一条给定的蛋白质序列,通过计算在马尔科夫模型下20个氨基酸残基的状态转移矩阵,建立一个420维的特征向量,然后利用支持向量机进行训练和预测,最后夹克刀检验证实了该方法的预测精度与以前的马尔科夫模型相比得到了一定的提高.

关键词: 蛋白质亚细胞位点马尔科夫模型支持向量机夹克刀检验序列特征

DOI：

分类号:

基金项目:省部级基金

Abstract:

Key words: