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PCR-DGGE分析湿地植物根际土壤细菌群落实验条件优化
丁陈利; 王平; 肖明
1
上海师范大学生命与环境科学学院
摘要
:
为了更好地利用PCR-DGGE技术分析湿地植物根际土壤样品的细菌多样性,选取3对通用引物,优化了PCR扩增16SrDNA的实验条件,并优化了DGGE的变性剂浓度梯度范围和电泳时间长度.结果显示:PCR时采用退火温度touch-down程序,能够提高扩增特异性.引物357f/518r和357f/907rM扩增靶序列的DGGE变性剂浓度梯度理想范围分别为50%～80%和40%～70%,最佳电泳时间长度分别为17h和14h.比较DGGE分析图谱的条带数以及Shannon多样性指数,357f/518r呈现的结果最
关键词
:
PCR
DGGE
群落多样性
通用引物
DOI：
分类号
:
基金项目:
省部级基金
Abstract
:
Key words
:
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